腹部外科主要治疗肝胆胰胃四类肿瘤疾患，胃癌尤其是进展期胃癌的综合治疗是科室的特色。该科室专病专治特点明显，医院的特殊资源优势，医院实力雄厚的放、化疗科团队开展MDT讨论，医院无法比拟的综合“作战”的优势。目前设有病床84张，现有医生16名，其中高级职称医生13名；具有博士后学位1人，博士学位5人，硕士学位者8名。
该科擅长开展各种类型的肝、胆、胰、胃恶性肿瘤手术治疗。胃癌的治疗是科室的第一大亮点，每年完成例左右胃癌手术。开展规范的胃癌D2,D3和选择性D4根治术；开展早期胃癌的腹腔镜胃癌根治术；在国内最早开展晚期胃癌的转化治疗以及进展期胃癌的术前新辅助化疗和放化疗临床研究，取得理想疗效。平均每年完成各类肝胆胰肿瘤切除手术余例，对巨块型肝癌、中央型肝癌，特别是肝尾状叶肿瘤开展左或右半肝或扩大半肝切除，肝尾状叶切除。对胰头癌、壶腹部癌以及胆总管下段癌常规开展胰十二指肠联合切除手术(Whipple’s术)，并具备肠系膜上静脉、门静脉血管重建能力，总切除率达70%以上，其中根治性切除率达50%以上。特别强调胰头癌的根治性切除和广泛的淋巴清扫，明显提高胰头癌患者的长期生存率。对胆囊癌、胆管癌常规开展肝十二指肠韧带骨骼化清扫术，明显提高了生存率。近年来开展的联合左或右半肝和尾状叶切除的肝门部胆管癌根治术大大提高肝门部胆管癌的R0切除。
该科室承担国自然、省自然以及中管局重大专项等多项重大科研课题，并承担多项国内外的横向临床科研项目。学科是浙江省中医药大学、温州医科大学、江苏大学医学院的硕士学位授权点。该科室是中国抗癌协会胃癌培训示范基地，至今已举办国家级进展期胃癌综合治疗继续医学教育项目共8年，参会代表覆盖全国范围。
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