QuestDiagnostics公司和IBMWatsonHealth近日宣布推出一项服务，为美国医生提供肿瘤基因组测序和分析以及癌症治疗建议。
这项服务代表着IBM先进的基因组学智能计算平台WatsonforGenomics已经不仅能服务于患者和肿瘤学家，而且能广泛地服务于提供大部分癌症治疗的社区肿瘤医生。
作为合作的一部分，纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSKCC）的精准肿瘤学知识库OncoKB将为Watson补充科学数据。Broad研究所将提供基因组测序服务，作为Quest公司测序服务的补充。
通过这项服务，临床医生可以将肿瘤组织寄送到Quest进行测序，然后测序数据将转给Watson进行分析。
Watson每个月会吸收约1万篇关于大约个新临床试验的科学论文和信息，该智能计算机会利用科研文献、药物数据和临床试验信息组成的庞大数据库进行检索，然后评估可能靶向肿瘤突变的治疗方法。Quest公司的病理学家审查Watson的报告后，将其发送给临床肿瘤医生。
Quest公司表示，该计划的关键是应用范围广。该公司在美国约一医院有客户，业务范围包括提供70%癌症治疗的社区肿瘤医生。
Quest公司的首席医疗官JayWohlgemuth说，“这项服务结合了Quest最先进的肿瘤分析技术、IBMWatson智能计算平台的全国访问权限和MSK的癌症治疗专业知识。这是一个非常强大的组合，我们相信这项服务将会超越传统的基因组服务，成为制定肿瘤靶向治疗方案的更好方法。”
纪念斯隆-凯特林癌症中心（MSKCC）临床研究副主任PaulSabbatini表示，通过这项服务，肿瘤医生将能够从MSKCC获得关于特定癌症基因改变的影响和治疗效果的专业信息。
基因组测序工具在微软云平台Azure上的运行速度变快7倍
研究人员和医生目前进行基因组序列分析使用的是BWA（Burrows-WheelerAligner）和GATK（GenomeAnalysisToolkit）软件。微软公司表示，这两种依赖于复杂计算的方法在Azure云平台上可以更加高效的运行。
微软云计算平台的这一新应用可以节省大量成本，对医院、诊所和研究所非常有吸引力，这些机构目前面临的基因组测序需求量以指数增长。微软公司基因组学小组的首席软件架构师RaviPandya说，“目前有成千上万个基因组需要进行测序，因此效率非常重要。”
目前微软公司正在和Broad研究所合作，对其GATK的未来版本进行改进。微软公司基因医院和其他医疗机构合作，找出更多Azure云平台在医疗中的使用空间。
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